不久前造成新墨西哥「灾变」的嵌合体寄生物突然在美国各地再次现身，不仅更加致命，散播的速度也更快了。为了监测寄生物，以及替日后的威胁做好万全准备，高度专精且装备精良的组织「彩虹司令部外源性分析与防控小队」（REACT）」因此成立。
世人对持续演化的寄生物所知甚微，REACT精心挑选的特勤干员是适合参与、反击与深入探究这些致命新威胁的不二人选。你的任务便是对抗比以往来得更加致命的神秘生物「古菌」。
特勤干员你的小队将会受到至少13种战术任务的挑战，每一项挑战都会有不同战场变数，带来千变万化的战场之余，也迫使你重新评价自身战略。不论是要从受污染的孵化囊中取得情资，或是猎杀菁英古菌体，你都必须牢记训练内容方可成功。
「嵌合体」寄生物以及它们的演化型「古菌」都是非常致命且会独立思考的生物体。REACT希望可以从独特却又致命的现象中理出头绪，因此你必须依靠队友以及自身直觉来面对10种以上的寄生古菌型态。以下会介绍几个最致命的种类：
就算你没注意它们的陷井，也会注意到其带来的致盲效果。留意脚下。
这种古菌除了能持续抛出投射物，还可以快速变形进出蔓生体来攻击目标。得盯紧它才行。
主要是强化其他古菌的支持物种，能让自身与其它古菌隐形。
毒爆体爆炸时会释出人类无法承受的毒气，它能向前冲刺并在接触后引爆。
这个可恶的召唤者会呼叫其他古菌协助战斗，要歼灭如此顶尖狩猎者必须特别构思的战术。
最后，你可能必须前往一个被称为「奇异点」的地方冒险，这个地区的所在地未知，你可能会遇见我们数据库中最具威胁性的古菌。
变化体是游走古菌变体，会化为REACT特勤干员的型态，有时甚至能模仿特勤干员的行为。当它们出现时，务必遵守交战协定，并极度谨慎地行动。